Un camarero llamado Desmond Miles, es secuestrado por Industrias Abstergo,una de las corporaciones multinacionales más grandes y prominentes del mundo. Dentro de una de sus instalaciones, Desmond se ve obligado a interactuar con un dispositivo llamado Animus, que es capaz de revivir los recuerdos situados en la memoria genética de los antepasados de quien la utilice. Abstergo busca información sobre un antepasado de Miles, llamado Altaïr Ibn-La’Ahad, asesino de la orden Hashsha-shin, en la época de la Tercera Cruzada.
