Shinnok invade la tierra junto con las fuerzas del Netherrealm acompañado de las almas de los luchadores que murieron durante la invasión de Shao Kahn. Johnny Cage y Sonya Blade junto a un nuevo equipo, abren un portal en la Cámara Jinsei, fuente de la vida del Reino de Earthrealm, en donde Raiden y Fujin luchan contra Shinnok; gracias a esto Raiden logra robar el amuleto de Shinnok y encarcelarlo dentro de él, pero Quan Chi logra escapar. Veinticinco años después, tendrán que defender la tierra de un nuevo emperador.
